Na UFABC, o ano letivo é dividido em três quadrimestres, sendo que cada quadrimestre compreende 12 semanas de atividades. Em consonância com o regimento, cada unidade de crédito corresponde a 12 (doze) horas de atividades programadas, compreendendo aulas, seminários, trabalhos de laboratório ou de campo, estudos individuais e redação da dissertação ou tese.

No curso de mestrado, para garantir uma formação básica em ensino e pesquisa em computação, o aluno deverá cursar um conjunto mínimo de disciplinas obrigatórias, a saber:

• Análise de algoritmos e estrutura de dados (12 créditos).
  Justificativa: A grande maioria de cursos de graduação em computação e áreas afins (engenharia de computação, informática, processamento de dados, sistemas de informação) contém ao menos uma disciplina relacionada a algoritmos e estrutura de dados. Dessa maneira, essa disciplina é de grande importância para a formação de docentes em computação, pois propicia um nivelamento em uma disciplina importante do currículo de computação e também para o aprofundamento em tópicos que poderão ser úteis durante a fase de implementação dos projetos de dissertação e tese.
• Metodologia de pesquisa em ciência da computação (12 créditos).
  Justificativa: Essa disciplina visa introduzir ao aluno à prática de pesquisa em ciência da computação, com ênfase à preparação de um trabalho de pesquisa em ciência da computação, tornando-o apto a desenvolver e avaliar sua pesquisa de pós-graduação, apresentando-o às especificidades e exigências da área e aprimorar seu senso crítico para a pesquisa.
• Seminários em Computação (2 créditos)
  Justificativa: As atividades de seminário ocupam um lugar de destaque na maioria dos centros universitários e programas de pós-graduação. É uma das ocasiões mais importantes em que novas ideias são apresentadas e discutidas com alunos, docentes e pesquisadores. O objetivo é propiciar ao aluno um contato com temas atuais de pesquisa, além da troca de experiências com pesquisadores experientes.

Além das disciplinas obrigatórias, são necessários mais 48 créditos em disciplinas eletivas O restante dos créditos poderá ser cursado nas demais disciplinas eletivas do curso: